مشخصات پژوهش

عنوان	ردیابی و تعیین ترداف ویروس کوتولگی زرد جو در مزارع غلات استان همدان
نوع پژوهش	مقاله ارائه شده کنفرانسی
کلیدواژه‌ها	لوتئوویریده، الیزای غیر مستقیم، RT-PCR، تعیین ترادف نوکلئوتیدی
چکیده	ویروس های گروه کوتولگی زردجو از مهمترین عوامل خسارت زا در غلات و محدود کننده کشت این محصولات دردنیا به شمار می روند. این ویروس ها متعلق به تیره Luteoviridae می باشند. ویروس عامل بیماری کوتولگی زرد جو (Barley yellow dwarf virus, BYDV) می تواند منجر به کاهش عملکرد 80 درصدی در گندم شود. مطالعات نشان می دهد که BYDV در اکثر نقاط ایران پراکنش دارد. با توجه به اهمیت و رتبه کشت غلات در استان همدان، پراکنش وسیع ویروس در کشور، شرایط آب و هوایی مساعد و فعالیت حشره ناقل، شرایط برای گسترش این ویروس در استان همدان فراهم آمده است. جهت ردیابی و شناسایی این ویروس، در بهار سال های 1399 و 1400 از مزارع گندم و جو استان همدان شامل شهرستان های ملایر، نهاوند، تویسرکان، همدان، اسدآباد، بهار، کبودرآهنگ، فامنین و رزن نمونه-برداری به عمل آمد. از هر منطقه 40 نمونه گیاهی دارای علائم زردی و کوتولگی به طور تصادفی جمع آوری شد. جهت تشخیص نمونه-های آلوده به BYDV آزمون الیزای غیرمستقیم طبق روش Converseو Martin انجام شد. در این آزمون آنتی بادی اختصاصی(Agdia) BYDV مورد استفاده قرار گرفت. نتایج آزمون الیزا نشان داد که از بین نمونه های جمع آوری شده دارای علائم بیماری به ترتیب 80٪ ، 90٪ ، 80٪ ، 80% ، 50% ، 50% ، 90% ، 90% و 90% نمونه های ملایر، نهاوند، تویسرکان، همدان، اسد آباد، بهار، کبودرآهنگ، فامنین و رزن نسبت به آنتی بادی BYDV واکنش مثبت نشان دادند. به منظور تایید آلودگی ها، استخراج آر ان ای کل با استفاده از کیت استخراج آر-ان ای شرکت دنازیست (Column RNA isolation kit) انجام شد و آزمون RT-PCR با استفاده از آغازگر های اختصاصی BYDV-PAV که سویه رایج این ویروس در اکثر مناطق کشور می باشد و قطعه ای با اندازه حدود 900 جفت باز از ژنوم (بخشی از ژن پلیمراز) را تکثیر می کند انجام شد. نتایج آزمون RT-PCR نتایج حاصل از آزمون الیزا را تایید نمود. سپس نمونهای از شهرستان تویسرکان به عنوان نماینده استان همدان، انتخاب و تعیین ترادف شد. تعیین ترادف در دو تکرار با استفاده از پرایمر های پیشرو و معکوس انجام شد. ترادف بدست آمده با سایر ترادف های موجود در بانک ژن مقایسه شد. نتیجه مقایسات انجام شده نشان داد که قطعه تعیین ترادف شده با جدایه های BYDV-PAV موجود در بانک ژن شباهت دارد و مشخص شد که جدایه تویسرکان بیشترین شباهت را با
پژوهشگران	نگار ردایی (نفر اول)، آرزو پاکدل (نفر دوم)