مشخصات پژوهش

عنوان	مقایسه مولکولی ژن پلیمراز ویروس کوتولگی زرد جو جدایه های همدان با سایر جدایه های موجود در بانک ژن
نوع پژوهش	مقاله ارائه شده کنفرانسی
کلیدواژه‌ها	BYDV، الیزای غیر مستقیم، RT-PCR، تعیین ترادف
چکیده	ویروس کوتولگی زرد جو (Barley yellow dwarf virus, BYDV) به طور قابل توجهی باعث کاهش محصول غلات و سایرگیاهان خانواده گندمیان در سراسر جهان می شود. این ویروس مهم و خسارتزا متعلق به جنس لوتئوویروس است که با شته ها منتقل می شود و باعث ایجاد علائم زردی و کوتولگی در گیاهان میزبان می گردد. مطالعات انجام شده نشان می دهد که این ویروس در اکثر نقاط ایران پراکنش دارد. به منظور ردیابی و شناسایی BYDV در استان همدان، در بهار سال های 1399 و 1400 نمونه های گیاهی دارای علائم بیماری، از مزارع گندم و جو شهرستان های ملایر، نهاوند، تویسرکان، همدان، اسدآباد، بهار، کبودرآهنگ، فامنین و رزن جمع آوری شدند. آزمون الیزای غیرمستقیم طبق روش Converse و Martin با استفاده از آنتی بادی اختصاصی BYDV تهیه شده از شرکت Agdia انجام شد. نتایج آزمون الیزا نشان داد که 80٪ نمونه های شهرستان ملایر، 90٪ نمونه های شهرستان نهاوند و80٪ نمونه های شهرستان تویسرکان،80٪ نمونه های شهرستان همدان، 50٪ نمونه-های شهرستان اسد آباد، 50٪ نمونه های شهرستان بهار، 90٪ نمونه های شهرستان کبودرآهنگ، 90٪ نمونه های شهرستان فامنین و 90٪ نمونه های شهرستان رزن به BYDV آلوده بودند. استخراج آر ان ای کل و آزمون RT-PCR با استفاده از آغازگر-های اختصاصی BYDV-PAV که سویه رایج این ویروس در اکثر مناطق کشور می باشد انجام شد. در این آزمون از جفت آغازگر PAV-ORF1-F و PAV-ORF-R که قطعه ای با اندازه حدود 900 جفت باز از ژن پلیمراز را تکثیر می کند استفاده شد .نتایج آزمون RT-PCR آلودگی به BYDV در اغلب مناطق نمونه برداری شده را تایید کرد. به منظور مقایسه مولکولی و تبارزایی، سه جدایه از شهرستان های همدان، تویسرکان و اسدآباد انتخاب و تعیین ترادف شد. تعیین ترادف در دو تکرار با استفاده از پرایمر های پیشرو و معکوس انجام شد. نتیجه مقایسات انجام شده نشان داد که قطعه تعیین ترادف شده با جدایه های BYDV-PAV موجود در بانک ژن شباهت دارد. مقایسه نتایج توالی یابی جدایه های استان همدان با سایر جدایه های ایرانی و غیرایرانی موجود در بانک ژن نشان داد جدایه تویسرکان و جدایه همدان بیشترین شباهت را با جدایه های کهنوج، کرج، یزد و اراک دارند (به ترتیب با 97٪ و 94٪ تشابه). درحالیکه این جدایه ها با سایر جدایه های ایرانی این ویروس شباهت کمی دارند ( حدود 85 درصد تشابه). همچنین جدایه
پژوهشگران	نگار ردایی (نفر اول)، آرزو پاکدل (نفر دوم)