عنوان
|
شناسایی چندشکلی های ژن HSP70A1A در گوسفندان نژاد مهربان و رومانف با تکنیک PCR-SSCP
|
نوع پژوهش
|
مقاله چاپشده در مجلات علمی
|
کلیدواژهها
|
تحمل سرمایی، چندشکلی نوکلئوتیدی، ژن HSP70A1A، گوسفند رومانف، گوسفند مهربان
|
چکیده
|
در اقلیمهای مختلف، نقش مقاومت سلولی به استرس های ناشی از تغییر دما از طریق خانواده ای از پروتئینها که اصطلاحاً، پروتئینهای شوک گرمایی (HSP) نامیده می شوند، کنترل می شود. در این راستا، در پژوهش حاضر، شناسایی چندشکلی های نوکلئوتیدی موجود در مناطقی از ژن HSP70A1A در گوسفند بومی نژاد مهربان و گوسفند وارداتی نژاد رومانف به جهت ویژگی این نژادها به سازگاری در اقلیم های سردسیری، بررسی شدند. بدین منظور، در مجموع، تعداد 141 حیوان شامل گوسفند نژاد مهربان (100 رأس) و گوسفند نژاد رومانف (41 رأس)، به طور تصادفی انتخاب و مراحل خونگیری و استخراج DNA طبق دستورالعمل های متداول انجام شد. سپس، واکنش زنجیرهای پلیمراز (PCR) جهت تکثیر اگزون ژن HSP70A1A (Oar_v4.0; Chr20, NC_019477.2) به اندازه باندی 247 و 298 جفت باز انجام شد. همچنین، جهت تعیین چندشکلی نمونهها از تکنیک PCR-SSCP و متعاقب آن، توالی یابی مبتنی بر سانگر استفاده شد. بر اساس نتایج SSCP، بطور مشابه در هردو نژاد مهربان و رومانف تعداد 5 الگوی باندی مشاهده شد که قطعات تکثیر شده 247 و 298 جفت بازی به ترتیب دو و سه الگوی الکتروفوزی را دارا بودند. علاوه بر این، هیچ تفاوتی در فراوانی الگوهای مشاهده شده بین این دو نژاد گوسفند یافت نشد. همچنین، در این نژادها نتایج توالی یابی وجود تعداد 5 چندشکلی نوکلئوتیدی (SNP) شامل g.26562252C>A، g.26562261G>C، g.26562270T>C، g.26562273C>T و g.26562279C>T در قطعه 247 جفت بازی و تعداد سه چندشکلی نوکلئوتیدی شامل g.26561745T>C، g.26561784C>T و g.26561877G>A در قطعه 298 جفت بازی شناسایی نمود. در مجموع، نتایج ثابت کرد که، همه چندشکلی ها بغیر ازg.26561745T>C و g.26561877G>A بطور معنی داری خارج از تعادل هاردی واینبرگ هستند (0/05p<). به عنوان نتیجهگیری نهایی، با توجه به نقش پروتئینهای شوک دمایی در مقاومت به استرس های محیطی، شناسایی این چندشکلی ها می تواند تاثیر بسزایی در درک مکانیسم سازگاری و تحمل سرمایی در نژادهای گوسفندان بومی ایرانی داشته باشد.
|
پژوهشگران
|
احمد احمدی (نفر اول)، محیا محمدی زاده (نفر دوم)، پویا زمانی (نفر سوم)، عباس فرح آور (نفر چهارم)، رضا طالبی (نفر پنجم)
|