عنوان
|
تعیین ویژگی های فنوتیپی و برخی نمایه های بیماری زایی گونه های عامل اسکب سیب زمینی در استان همدان
|
نوع پژوهش
|
پایان نامه
|
کلیدواژهها
|
گوناگونی، ریخت شناسی، Streptomyces
|
چکیده
|
استان همدان یکی از مناطق مهم کشت سیب زمینی در ایران است.بیماری جرب معمولی سیب زمینی به علت گوناگونی در علائم و گونه های باکتری عامل بیماری، نوع میزبان و شرایط مناسب خاک جهت گسترش بیماری مورد توجه قرار گرفته است، از آنجا که یکی از بیماری های مهم باکتریایی سیب زمینی در استان همدان، بیماری جرب معمول سیب زمینی است، گوناگونی باکتری عامل بیماری برپایه ویژگی های فنوتیپی بررسی شد. در سال زراعی 1397 شمار266 جدایه Streptomyces از غده های سیب زمینی با علائم مختلف بیماری جرب معمولی از مناطق مختلف استان همدان جداسازی شد. با توجه به شمار بالای جدایه ها، شمار 60جدایه برپایه شکل و رنگ کلنی و نوع زنجیره اسپوری برای بررسی های بعدی گزینش شدند. جدایه های برگزیده برپایه الگوی پروتئین سلولی با استفاده از روش SDS-PAGE در10 گروه قرار گرفتند. برای آزمون بیماری زایی مقدماتی روی غده و برش غده سیب زمینی در آزمایشگاه، از هر گروه سه جدایه گزینش شدند که هفت گروه قادر به ایجاد علائم بودند. برای تعیین شدت بیماری زایی در شرایط گلخانه روی غده های سیب زمینی، از هر گروه یک جدایه شامل A14، A21، A46، A71، A85، A96 وA107 گزینش شدند. آزمون بیماری زایی در شرایط گلخانه در یک طرح بلوک کاملاً تصادفی انجام شد و تجزیه و تحلیل داده های به دست آمده از آزمون بیماری زایی در شرایط گلخانه به کمک از نرم افزار SAS 9.4 انجام شد. همه جدایه قادر به ایجاد علائم بیماری جرب معمولی روی غده های سیب زمینی در شرایط گلخانه بودند و جدایه های A107، A96 و A46 به ترتیب بیشترین توان بیماری زایی را نشان دادند و علائم جرب برجسته، جرب سطحی و جرب فرورفته را روی غده های سیب زمینی پنح ماه پس از مایه زنی به خاک ایجاد کردند. یافته های به دست آمده از BOX-PCR نشان داد که جدایه ها در سطح تشابه 55 درصد در چهار گروه قرار گرفتند. شناسایی جدایه ها با استفاده از آزمون های فنوتیپی و توالی یابی ژن های 16S rRNA و rnpB انجام شد. بر اساس یافته های آزمون های فنوتیپی جدایه های A14 به عنوان Streptomyces scabiei، A21 به S. acidiscabies، A46 به S. caviscabies و A96 به S. griseus شناسایی شدند. جدایه های A71، A85 و A107 از نظر فنوتیپی در سطح گونه قابل شناسایی نبودند. بر اساس توالی ژن rnpB جدایه A14 51/90 درصد به Streptomyces scabiei DSM 41005 ، جدایه A21 11/91درص
|
پژوهشگران
|
غلام خداکرمیان (استاد راهنما)، اشکان عالی محمدی (دانشجو)
|