مشخصات پژوهش

صفحه نخست /مقایسه توالی ژن های مقاومت به ...
عنوان مقایسه توالی ژن های مقاومت به بیماری در ژنوتیپ های مختلف چغندرقند موجود در پایگاه های اطلاعاتی
نوع پژوهش پایان نامه
کلیدواژه‌ها چغندر قند، ژن های مقاومت به بیماری، جهش، نشانگرهای پیوسته
چکیده چغندر قند با نام علمی (Beta Vulgaris) یکی از مهم ترین منابع تامین کننده شکر در جهان است.چغندرقند یکی ازمهم ترین محصولات مناطق معتدل است و در مناطق وسیعی از دنیا کشت شده است . این گیاه در نواحی توسعه خود با بسیاری از بیماری های ناشناخته روبرو شده است. مهم ترین راه مبارزه با این بیماری ها استفاده از ارقام مقاوم است . بکارگیری ابزارهای بیوانفورماتیکی می تواند نقش ،تنوع و عملکرد بسیاری از توالی های موجود در پایگاه بیوانفورماتیکی را تعیین کند . شناسایی و بررسی ژن های مربوط به مقاومت به بیماری های چغندر قند در ژنوتیپ های مختلف در این پایگاه ها، امکان معرفی نشانگرهای پیوسته به مقاومت به بیماری ها را در گیاه چغندر قند میسر می سازد. دراین پژوهش ،توالی رونوشت 315 ژن کاندید مقاومت به بیماری ازژنوتیپ مرجعKWS2320 در پایگاه NCBI بررسی شدند و توالی مشابه آن ها در ژنوتیپ های دیگر برای 315 ژن شناسایی گردید . توالی رونوشت ژن های مقاومت به بیماری در ژنوتیپ های مختلف چغندر قند باهم مقایسه شدند . تعداد 5706 جهش شناسایی شد که از این تعداد 3586 عدد ازنوع حذف / اضافه و 2120 مورد از نوع جانشینی بودند . میزان جهش به طور متوسط یک جهش در50 تعداد باز بدست آمد و تغییرات احتمالی پروتئین ها نیز بررسی شد. از جهش های شناسایی شده می توان در ایجاد نشانگرهای پیوسته به مقاومت به بیماری های چغندر قند نظیر CAPs بهره برد.
پژوهشگران اصغر میرزائی اصل (استاد راهنما)، ندا بابایی اصل (دانشجو)، خسرو پیری (استاد مشاور)