مشخصات پژوهش

عنوان	تعیین تیپ ژنتیکی استافیلوکوکوس اورئوسهای جدا شده از منابع مختلف بر اساس کاست کروموزومی SCCmec) mec) و پلی مورفیسم ژن های coa و spa
نوع پژوهش	پایان نامه
کلیدواژه‌ها	استافیلوکوکوس اورئوس ، بیوتایپینگ، RFLP، RAPD، SCCmec، PFGE،
چکیده	تعیین تیپ استافیلوکوکوس اورئوس جهت تعیین چگونگی توزیع و اپیدمیولوژی آن، ارتباط بین پاتوژن ها و طراحی روش هایی جهت کنترل بیماری های ناشی از آن ها امری لازم و ضروری می باشد. هدف از مطالعه اخیر، تعیین ارتباط ژنتیکی احتمالی بین جدایه های استافیلوکوکوس اورئوس با منابع مختلف و شناسایی مسیرهای احتمالی انتشار عفونت با استفاده از روش های مولکولی و فنوتیپی بود. این تحقیق یک مطالعه توصیفی- تحلیلی بود که در سال های 1393 تا 1395 انجام گردید. جامعه هدف در این مطالعه، 208 جدایه استافیلوکوکوس اورئوس (83 جدایه دامی، 60 جدایه انسانی و 65 جدایه غذایی) بود که همه آنها با استفاده از روش های فنوتیپی (بیوتایپینگ) و مولکولی شامل: (Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD و Restriction Fragment Length Polymorphism(RFLP) بر اساس ژن های spa (ژن کدکننده پروتئین A) و coa (ژن کد کننده کوآگولاز) مورد تایپینگ قرار گرفتند. در ادامه، تعدادی از جدایه ها با روش های (Staphylococcal Cassette Chromosome mec) SCCmec، ترادف یابی یک جایگاهی ((Single-locus Sequence Typing (SLST) ژن spa و الکتروفورز در میدان الکتریکی ضربان دار (Pulsed-field gel Electrophoresis (PFGE)) تیپ بندی شدند.آنالیز پروفایل ها و رسم دندروگرام برای روش های RAPD-PCR و PFGE به ترتیب با استفاده از نرم افزارهای NTSYS-PC و Gel Compar II انجام گرفت و تیپ های spa با نرم افزار (Applied Maths) BioNumerics 7.6 تعیین شد. از 208 جدایه استافیلوکوکوس اورئوس که با روش بیوتایپینگ دسته بندی شدند، 96 جدایه (2/46 درصد) متعلق به بیوتیپ های با میزبان خاص (Host Specific: HS) گزارش شد که شامل 30 اکوار انسانی، 23 اکوار گاوی، 30 اکوار گوسفندی و 13 اکوار مرغی بود و 90 جدایه (2/43 درصد) در گروه بیوتیپ های بدون میزبان خاص (Non-host Specific: NHS) جای گرفت و بقیه جدایه ها (6/10 درصد) در هیچ تیپی قرار نگرفتند. در روش RAPD-PCR، در مجموع 47 پروفایل مختلف مشاهده شد و در تشابه 80 درصد، 9 خوشه ایجاد شد که بیشتر سویه های جدا شده از منابع مختلف در خوشه های مشخص قرار گرفتند. درمجموع نتایج RFLP-spa در بین 208 جدایه استافیلوکوکوس اورئوس، با استفاده از دو آنزیم HindIII و HinfI، 15 الگو و در RFLP-coa با استفاده از آنزیم AluI، 12 الگوی مختلف ایجاد شد. در روش SCCmec تایپینگ هم، بیشت
پژوهشگران	عبدالمجید محمدزاده (استاد راهنما)، رضا حکیمی النی (دانشجو)، پژمان محمودی کوهی (استاد مشاور)، محمدیوسف علیخانی (استاد مشاور)