مشخصات پژوهش

عنوان	شناسایی ایندل ها در بخشی از ژنوم بلدرچین ژاپنی
نوع پژوهش	مقاله ارائه شده کنفرانسی
کلیدواژه‌ها	دی ان ای، بلدرچین، جهش الحاقی، جهش حذفی
چکیده	بلدرچین ژاپنی برای تولید گوشت و تخم و بعنوان یک حیوان آزمایشگاهی مورد توجه قرار گرفته است. هدف از این پژوهش جستجوی ایندل ها (یکی از منابع مهم تنوع ژنتیکی) در بخشی از ژنوم بلدرچین می باشد. در این پژوهش با استفاده از توالی DNA بخشی از ژنوم 78 بلدرچین ژاپنی توالی مرجع در حدود 6/8 مگا باز با کانتیگ های منحصر به فرد 95 بازی ایجاد شد. سپس توالی DNA تک تک نمونه ها با این توالی مرجع نقشه یابی شدند که پس از شناسایی نقاط شکست در نهایت 1046 ایندل شناسایی شد که توزیع فراوانی آنها در ژنوم مورد مطالعه به ازای هر Kb 2/8 یک ایندل یافت شده است و از این میان حدود 75 و 25 درصد بترتیب به جهش های الحاقی و حذفی تعلق داشت که درصد بالایی از ایندل ها با طولی در محدوده 20-1 جفت باز قرار داشتند که در بین آنها جهش های الحاقی با طول یک باز بیشترین فراوانی را به خود اختصاص داده بود. فراوانی ژنوتیپی ایندل های هموزیگوت و هتروزیگوت در کل ایندل ها به ترتیب به نسبت دو به یک شناسایی شد. در نهایت با توجه به تراکم ایندل یافت شده در بخشی از ژنوم جمعیت مورد مطالعه، تنوع ایندلی کمی وجود داشت.
پژوهشگران	احمد احمدی (نفر اول)، جواد قره غانی (نفر دوم)، صاحب فروتنی فر (نفر سوم)