عنوان
|
یررسی ویژگی های فنوتیپی و تنوع ژنتیکی باکتری های گره زای ریشه برخی گیاهان تیره Fabacea
|
نوع پژوهش
|
پایان نامه
|
کلیدواژهها
|
: انگشت نگاری ژنتیکی، باکتری همزیست، تنوع ژنتیکی، توالی یابی، rep-PCR، 16S-RFLP
|
چکیده
|
طی سال های 1392 و 1393، صدو پنجاه استرین باکتریایی از خاک و گره ریشه گیاهان نخود، لوبیا، یونجه، شبدر و خلر از استان های آذربایجان شرقی و همدان جداسازی شد. در آزمون گره زایی، از بین این استرین ها، 11 استرین نتوانستند روی گیاه میزبان خود گره ایجاد کنند در حالیکه بیشتر استرین ها، پس از 5 هفته گره هایی، روی گیاه میزیان خود ایجاد کردند. شناسایی گونه و تنوع استرین ها با مقایسه ویژگی های فنوتیپی، انگشت ژنتیکی حاصل از rep-PCR، 16S rRNA-RFLP و توالی یابی ژن های nodC، nifH، recA و atpD با یکدیگر و با استرین های مرجع ارزیابی گردید. براساس انگشت نگاری ژنتیکی حاصل از روش های Box و ERIC-PCR استرین های نخود، یونجه، لوبیا، شبدر و خلر به ترتیب به شش، چهار، هفت، پنج و چهار گروه تقسیم شدند. این نتایج نشان دهنده تنوع ژنتیکی بالا بین استرین ها است. در روش16S rRNA-RFLP ، استرین های نخود، لوبیا، یونجه، شبدر و خلر به ترتیب تشکیل هفت، نه، دوازده، شش و سه ژنوتیپ را دادند آتالیز فیلوژنی، براساس توالی یابی ژن های nodC، nifH، atpD و recA نشان داد که نماینده ی استرین های نخود به Mesorhizobium mediterraneum، M. ciceri و Agrobacterium tumefaciens، نماینده ی استرین های لوبیا به گونه های Rhizobium leguminosarum، R. giaridinii، R. etli و R. tropici، استرین های یونجه به Sinorhizobium meliloti، S. medicae و A. tumefaciens، استرین های شبدر به R. leguminosarum bv. triflolli ، S. melilot و A. tumefaciens و استرین های خلر به R. leguminosarum و گونه ی جدید R. iranicum sp. nov. تعلق دارند. در تحقیق حاضر براساس ویژگی های فنوتیپی و ژنوتیپی دو گونه ی R. tropici و R. giardinii به عنوان همزیست لوبیا برای اولین بار از ایران و R. iranicum به عنوان همزیست با خلر برای اولین بار در دنیا گزارش می گردد.
|
پژوهشگران
|
غلام خداکرمیان (استاد راهنما)، کیومرث روح رضی (دانشجو)
|