مشخصات پژوهش

عنوان	برهمکنش باکتریهای همراه و محرک رشد جدا شده از غده کامل سیب زمینی با Streptomyces scabies عامل بیماری اسکب معمولی
نوع پژوهش	پایان نامه
کلیدواژه‌ها	کنترل بیولوژیکی، توالی یابی، استرپتومایسس اسکبیس، سودوموناس، پی سی آر
چکیده	سیب زمینی به طور میانگین با تولید سالانه 22 تن در هکتار بعد از برنج و گندم سومین محصول پر مصرف در ایران است. بیماری اسکب معمولی در سیب زمینی توسط Stereptomyces scabies ایجاد و از جمله بیماری های مهم سیب-زمینی است که باعث زیان اقتصادی می شود. استرین های S.scabies از زخم های سیب-زمینی آلوده روی محیط کشت PDA جدا شد و پس از خالص سازی بیماریزایی آن ها اثبات گردید. از آنجا که یکی روش های مدیریت بیماری های گیاهی کنترل بیولوژیک است، در این مطالعه، استرین های باکتری از غده های سالم سیب زمینی جدا و سپس توانایی آن ها در مهار S.scabies مورد بررسی قرار گرفت. تعداد 74 استرین باکتری از غده های سالم سیب زمینی روی محیط کشت آگار غذایی جدا و خالص شد. به منظور انتخاب نماینده استرین های یکسان برای شناسایی، پروتئین های محلول سلولی استرین های باکتریایی استخراج و در ژل اکریلامید 12% الکتروفورز شد. نتایج شناسایی استرین های نماینده با روش های استاندارد باکتری شناسی نشان داد که باکتری های جدا شده از غده های سالم سیب زمینی وابسته به جنس های Pseudomonas، Bacilus و Ralstonia و خانواده Entrobacteriaceae هستند. استرین های باکتری های جدا شده از غده های سالم سیب-زمینی با روش کشت متقابل با S.scabies در آزمایشگاه در قالب طرح کاملا تصادفی با سه تکرار مورد مطالعه قرار گرفتند. نتایج نشان داد که سه استرین EMJ12، EMJ42 و EMJ14 به ترتیب با داشتن میانگین قطر هاله بازدارندگی از رشد به میزان 10/3، 10/3 و 36/2 بیشترین اثر را در مهار رشدی عامل بیماری داشتند. نتایج حاصل از اثر استرین ها روی رشد گیاه سیب-زمینی و کاهش علایم حاصل از بیماری اسکب سیب زمینی نشان داد که سه جدایه EMJ8، EMJ14 و EMJ12به ترتیب به میزان 94%، 84% و 72% بهترین اثر و دو استرین EMJ10 و EMJ9 به ترتیب به میزان 15% و 35% کمترین اثر را در کنترل بیماری و رشد سیب زمینی داشتند. برای شناسایی دقیق باکتری از روش PCR استفاده شد. ژن کد کننده 16SrRNA دو استرین MJ8 و EMJ14 با استفاده از آغازگرهای MoF(10f) و MOR(1507r) توسط روش PCR تکثیر شد و توالی یابی شد و پس از بلاست در سایت NCBI ، درخت فیلوژنی آن رسم شد. توالی دو استرین EMJ8 و EMJ14 به ترتیب با توالی دو باکتری Pseudomonas Putida و Pseudomonas Salomonii بالاترین شباهت را نشان داد.
پژوهشگران	غلام خداکرمیان (استاد راهنما)، الهام موسوی جعفری پور (دانشجو)