تا کنون تحقیقات متعددی در خصوص اندرکنش کانی های رسی و آلاینده های آلی صورت گرفته است اما تعداد اندکی از آن ها مطالعه ریزساختاری فرآیند اندرکنش بنتونیت و آلاینده آلی را بررسی کرده اند. از سوی دیگر، با توجه به آنکه مراکز دفن زباله، مراکز صنعتی و پالایشگاه ها در اثر بارش یا نفوذ آب از راه های گوناگون دیگر، به طور مکرر در معرض فرایندهای تر و خشک شدن قرار می گیرند بر این اساس دو مکانیزم متفاوت در آلوده شدن خاک شامل اندرکنش خاک قبل و بعد از هیدراته شدن اولیه خاک امکان وقوع دارد. ضمن آنکه تئوری های موجود در مطالعه فرایند اندرکنش خاک-آلاینده اثر هیدراسیون اولیه را در محاسبات منظور نمی کنند. تحقیق حاضر با هدف مطالعه تأثیر شرایط اولیه هیدراسیون خاک در فرایند اندرکنش خاک و آلاینده آلی از منظر ریزساختاری و درشت ساختاری انجام شده است. اصولاً مطالعه پراش پرتو ایکس خاک روش مفیدی برای شناخت رفتار ریزساختاری خاک های رسی است. این روش تا حدود زیادی نشان دهنده ی تغییرات رفتاری خاک های رسی در شرایط مختلف زیست محیطی و ژئوتکنیکی است. برای مطالعه تأثیر شرایط هیدراسیون اولیه خاک بر فرایند اندرکنش خاک و آلاینده آلی، نمونه های بنتونیت در شرایط هیدراسیون اولیه و فقدان هیدراسیون اولیه در معرض غلظت های مختلف اتانول و اسید استیک به عنوان آلاینده آلی قرارگرفته و تغییرات ریزساختاری بنتونیت در دو سری آزمایش های فوق مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفته است. نتایج به دست آمده از پژوهش حاضر حاکی از آن است که شرایط هیدراسیون اولیه به طور کلی موجب بهبود خصوصیات خاک در فرایند اندرکنش خاک و آلاینده آلی می شود. نتایج اخذ شده فوق در افزایش عملکرد لایه های رسی مراکز دفن مهندسی زباله کاربرد عمل و اجرائی دارد.