1404/02/01

صادق صالح زاده

مرتبه علمی: استاد
ارکید:
تحصیلات: دکترای تخصصی
اسکاپوس:
دانشکده: دانشکده شیمی و علوم نفت
نشانی:
تلفن:

مشخصات پژوهش

عنوان
مطالعه تئوری پروتونه شدن کامل و همچنین کاتیون فلزخواهی (Na+، K+، Mg2+، Ca2+، Fe2+ و Zn2+) آدنین در فازهای گاز و محلول
نوع پژوهش
پایان نامه
کلیدواژه‌ها
مطالعات نظری، آدنین، پروتون خواهی، کاتیون فلزخواهی، فاز گاز، فاز محلول
سال 1402
پژوهشگران سپیده علیزاده(دانشجو)، صادق صالح زاده(استاد راهنما)

چکیده

این پروژه، شامل یک مطالعه ی نظری بر روی پروتون خواهی و کاتیون فلزخواهی مولکول آدنین با استفاده از برنامه GAUSSIAN 09 می باشد. آدنین یک نوکلئوباز پورین است. پورین یک ترکیب آلی آروماتیک هتروسیکلیک است که از دو حلقه هتروسیلیک (پیریمیدین و ایمیدازول) تشکیل شده است که به یکدیگر متصل شده اند. در اینجا انرژی پروتونه شدن اتم های مختلف نیتروژن مولکول آدنین در فاز گاز و محلول آبی در دو سطح تئوری M06-D3 و MP2 و با استفاده از مجموعه پایه def2-TZVPP محاسبه و مقایسه شد. ثابت میکروپروتون خواهی برای تمام اتم های نیتروژن آدنین در محلول نیز محاسبه شد. پروتونه شدن کامل این مولکول نیز مورد بررسی قرار گرفت و پایدارترین ایزومرها برای adenine ، adenine ، adenine و adenine در فازهای گاز و محلول تعیین شدند. همچنین ثابت بازی تئوری برای پروتونه شدن آدنین محاسبه و با مقدارتجربی موجود مقایسه شد. pKb محاسبه شده در محلول با مدل های CPCM،PCM ،DPCM و SMD نزدیکی خوبی با pKb تجربی بدست آمده از پژوهش های گذشته دارد. مقادیر pKb بدست آمده با مدل های CPCM و PCM به ترتیب برابر 84/9 و 67/9 بوده و به مقدار تجربی، 70/9=pKb، بسیار نزدیک است. سپس کاتیون فلزخواهی مولکول آدنین برای یون های Na+، K+، Mg2+، Ca2+، Fe2+ و Zn2+ که فراوان ترین یون های فلزی موجود در بدن انسان هستند در فاز گاز و در سطح تئوری M06-D3/def2-TZVP بررسی شد. بنابراین توانایی اتم های نیتروژن مختلف آدنین برای اتصال به یون های فلزی فوق مقایسه شد. نتایج نشان می دهد که اگرچه اتم نیتروژن شماره 2 دارای بیشترین پروتون خواهی است اما تنها در مورد یون K+ بیشترین کاتیون فلز خواهی را دارد. همچنین در مورد یون های Na+، Mg2+، Ca2+و Zn2+، اتم نیتروژن شماره 3 دارای بیشترین کاتیون فلز خواهی است. در پایان، نحوه اتصال آدنین دپروتونه شده ( آنیون آدنین) به حامل داروی [Zn(tren)]2+ نیز مورد بررسی قرار گرفت. نتایج بدست آمده از این پروژه، با نتایج تجربی مربوطه مطابقت دارند.