چکیده اندوفیت های گیاهی به دلایلی مانند اثر بر رشد گیاه و تولید فرآوده های مختلف به ویژه فرآوده هایی با خاصیت دارویی، از اهمیت بالایی برخوردار هستند. مطالعات نشان داده است که اندوفیت ها قادر به تولید متابولیت های مشابه با میزبان هستند. این مطلب می تواند در تولید متابولیت های با ارزش گیاهی دستاورد مهمی باشد. قسمت های مختلف گیاه فرفیون و سلمه تره در تابستان هزار و سیصد و نود و پنج، از دو منطقه در استان همدان جمع آوری شدند. نمونه برداری از شش بافت مختلف؛ گل، برگ، جوانه، ریشه، طوقه و ساقه صورت گرفت. از دو گیاه جمع آوری شده، هفده اندوفیت باکتریایی و سی و یک اندوفیت قارچ جداسازی شدند. برای تعدادی از جدایه های قارچ شناسایی مورفولوژیک صورت گرفت. آزمایشات بیوشیمیایی از قبیل حضور آنزیم های خارج سلولی (آمیلاز، لیپاز، پروتئاز، سلولاز، پکتیناز، زایلاناز، لاکاز)، حضور کیفی برخی متابولیت های ثانویه، تولید کیفی و کمی تاکسول، و تاثیر عصاره اندوفیت بر جوانه زنی بذر چند گیاه بررسی شدند. نتایج نشان داد هفتاد و هفت درصد از جدایه های قارچی و شصت و شش درصد از جدایه-های باکتریایی دارای آنزیم خارجی پروتئاز، چهل پنج درصد سلولاز و سی و پنج درصد پکتیناز بودند. عصاره اندوفیت ها اثر منفی بر جوانه زنی بذور گیاهی نشان داد. در برخی از عصاره ی اندوفیت های باکتریایی، حضور آلکالوئید ها و ترپن ها دیده شد. تولید تاکسول در عصاره هشت جدایه از اندوفیت های باکتریایی و عصاره ی گیاه فرفیون به روش اچ پی ال سی تایید گردید. بیشترین مقدار تولید تاکسول در جدایه آده با مقدار بیست و دو میکروگرم در میلی لیتر گزارش شد. بررسی های مولکولی چهار جدایه باکتری آده، آسی و پنج، ب سیزده و ب پانزده انجام شد.
