سیب با نام علمی Malus domestica Borkh. گیاهی چند ساله از تیره ی گل سرخیان (Rosaceae) می باشد که از لحاظ اقتصادی به عنوان یک محصول عمده کشاورزی در جهان شناخته می شود. استان آذربایجان غربی با تولید 743 هزار تن سیب در سال رتبه ی اول در تولید این میوه در کشور را داراست. اخیرا پوسیدگی های ریشه و طوقه سالانه موجب مرگ و میر نهال های جوان و درختان سیب در باغ ها و نهالستان های استان آذربایجان غربی می شود. به منظور شناسایی قارچ های همراه ریشه و طوقه درختان سیب رو به زوال در سطح استان، در بهار و تابستان 1396 از باغ های سیب در مناطق مختلف نمونه برداری صورت گرفت. جداسازی گونه های قارچی با کشت بافت روی محیط سیب زمینی دکستروز آگار و خالص سازی با استفاده از روش نوک ریسه انجام گرفت. بر اساس ویژگی های ریخت شناختی و کلید های شناسایی معتبر، گونه هایClonostachys rosea ،Alternaria atra ،Rhizoctonia sp. ،Phytopythium litorale ،Truncatella angustata ،Trichoderma harzianum ،Trichoderma atroviride ، Trichoderma arundinaceu وFusarium acuminatum شناسایی شدند. به منظور تایید خصوصیات ریخت شناختی، ناحیه ITS در تعدادی از جدایه های منتخب برخی از گونه ها تکثیر شد. در این پژوهش پنج گونه ی Clonostachys rosea ، Alternaria atra ، Phytopythium litorale ، Trichoderma arundinaceuو Trichoderma atroviride برای اولین بار در دنیا و گونه های Truncatella angustata ، Fusarium acuminatum و Rhizoctonia sp برای اولین بار در ایران از درختان سیب جدا و گزارش می شود.