هویج گیاهی علفی دوساله به نام علمی Daucus carato ssp sativus از تیره چتریان است. این گیاه در معرض انواع بیماری های قارچی، باکتریایی، ویروسی قرار دارد. یکی از بیماری های مهم هویج بیماری پوسیدگی نرم باکتریایی ناشی از Pectobacterium caratovorum است. مبارزه با این بیماری دشوار بوده و یکی از مهم-ترین روش ها کنترل بیولوژیک است که این بررسی در همین راستا انجام گرفته -است. نمونه های هویج مشکوک به بیماری پوسیدگی نرم از مزارع استان همدان، در پاییز سال 1392 جمع آوری و استرین های P. caratovorum روی محیط کشت EMB جدا شد. غده های هویج از مزارع استان همدان به طور تصادفی با حرکت زیگزاگی در مزرعه انتخاب و جمع آوری شدند. باکتری های رایزوسفر از ریشه هویج جدا و توانایی بازدارندگی 44 استرین منتخب علیهP. caratovorum در قالب طرح کاملا تصادفی در شرایط آزمایشگاه ارزیابی شد. براساس قطر هاله بازدارندگی در این شرایط استرین های MM2 و MM8 به ترتیب بیشترین و کمترین اثر علیه P. caratovorum را نشان دادند. با توجه به تفاوت در میزان بازدارندگی و با مقایسه الگوی الکتروفورزی پروتئین های محلول سلولی هشت استرین به عنوان نماینده انتخاب شدند. براساس آزمون های بیوشیمیایی و فیزیولوژیکی مشخص شد که این استرین ها وابسته به جنس های Pseudomonas ,Xanthomonas ,Enterobater و Pantoa هستند. بازدارندگی باکتری های رایزوسفر در شرایط گلخانه با روش آغشته سازی بذر و خاک در قالب طرح کاملا تصادفی با سه تکرار مورد بررسی قرار-گرفت. در این شرایط ویژگی های طول و وزن برگ و غده، و شدت بیماریزایی بر اساس شادابی و میزان لهیدگی و هم چنین فراوانی کلنی های P. caratovorum مورد سنجش قرار گرفت. نتایج نشان داد که استرین هایMM2a2, و MM1a2 به ترتیب بیشترین تاثیر را در افزایش رشد گیاه و کاهش شدت بیماری داشتند. ژن های کد کننده 16SrRNA استرین های برگزیده با استفاده از پرایمر های اختصاصی در واکنش زنجیره ای پلی مراز(PCR) تکثیر و تعیین توالی شد. توالی های به دست-آمده با داده های موجود در بانک اطلاعاتی سایت NCBI بلاست شد. نتایج نشان داد که استرین هایMM2,MM1,MM8 به ترتیب 99 درصد باتوالیSrRNA16 در باکتری-هایPantoa conspicua، Pseudomonas fleuresant وEnterobacter amniginus شباهت دارند.