پویا زمانی

سطوح پروتئین های سرم خون با وضعیت فیزیولوژیکی و سلامت دام در ارتباط هستند و می توانند تحت تأثیر آثار ژنتیکی و محیطی قرارگیرند. هدف از پژوهش حاضر بررسی تنوع ژنتیکی و شناسایی QTL ها و ژن های کاندیدای مرتبط با الگوی پروتئین های سرم خون در گوسفند بود. نمونه های خون به طور تصادفی از 96 میش لری – بختیاری سالم، در ایستگاه اصلاح نژاد شولی، واقع در استان چهار محال و بختیاری جمع آوری شدند. حیوانات نمونه گیری شده به طور تصادفی به گروه های متفاوتی از سن، نوع تولد، فصل تولد و وزن بدن تعلق داشتند. نمونه های خون از سیاهرگ وداج گرفته شدند و در دو نوع تیوب بدون EDTA و دارای EDTA جمع آوری شدند. نمونه های خون جمع آوری شده در لوله های بدون EDTA برای اندازه گیری بخش های مختلف پروتئین های سرم مورد استفاده قرار گرفتند. بخش های پروتئینی اندازه گیری شده در سرم خون شامل پروتیئن تام (TP)، آلبومین (A)، گلوبولین (G)، نسبت آلبومین به گلوبولین (A/G)، آلفا1 گلوبولین (α1)، آلفا2 گلوبولین (α2)، بتاگلوبولین(β)، گاما گلوبولین(γ) و ایمنوگلوبولین جی(IgG) بودند. پروتئین تام سرم به روش استاندارد بیوره با یک دستگاه اتوآنالایزر بیوشیمیایی اندازه گیری شد. پروتئین های سرم خون به روش الکتروفورز روی ژل استات سلولز جداسازی و اندازه گیری شدند. برای تعیین سطوح IgG از یک دستگاه الایزا ریدر استفاده شد. DNA ژنومی از نمونه های خون کامل جمع آوری شده در لوله های دارای EDTA، با استفاده از کیت سیناژن استخراج شد. نمونه ها با استفاده از آرایه های 50 هزار نشانگری شرکت ایلومینا تعیین ژنوتیپ شدند. کنترل کیفیت داده های تعیین ژنوتیپ با استفاده از نرم افزارهای R و Plink ویرایش 90/1 بتا انجام شد. پویش ژنومی با استفاده از نرم افزار Plink ویرایش 90/1 بتا انجام شد و نمودارهای منهتن و Q-Q با استفاده از نرم افزار R تشکیل داده شدند. در تجزیه پویش ژنومی، صفات تصحیح شده برای سن، نوع تولد و فصل تولد و ارزش اصلاحی برآورد شده برای وزن بدن به عنوان شبه فنوتیپ در نظر گرفته شدند. در مدل پویش ژنومی، برای تصحیح اریب ناشی از لایه بندی احتمالی جمعیت، پنج مؤلفه اصلی به عنوان متغیرهای همبسته در نظر گرفته شدند. نرم افزار GCTA برای برآورد واریانس ژنتیکی صفات مورد بررسی به کار برده شد. ژن گاه های صفات کمی (QTL) و ژن های کاندید مرتبط با صفات مورد مطالعه،