پویا زمانی

وزن بدن یکی از مهم ترین صفات کمّی در گوسفند گوشتی است. چندین ژن عمده ی مؤثر بر صفات اقتصادی حیوانات مزرعه ای، با استفاده از پویش ژنومی و نقشه برداری ژنتیکی حیوانات شناسایی شده اند. هدف از انجام این پژوهش اجرای یک مطالعه پیوستگی در سطح ژنوم (GWAS) برای شناسایی تک نوکلئوتیدهای (SNPs) معنی دار مرتبط با وزن تولد و واکاوی مناطق ژنومی پیرامون این SNPها برای ژن های کاندید احتمالی مؤثر بر این صفت در گوسفند بود. تعداد 132 رأس گوسفند لری-بختیاری متعلق به گله موجود در ایستگاه اصلاح نژاد استان چهارمحال بختیاری واقع در شهرستان شهرکرد برای این پژوهش به کار برده شدند. از بین حیوانات نمونه گیری شده 66 گوسفند ماده بر اساس روش موردی/شاهدی، با توجه به ارزش اصلاحی برآورد شده برای وزن بدن (33 فرد دارای ارزش اصلاحی بالا و 33 فرد دارای ارزش اصلاحی پایین) انتخاب شدند. 66 نمونه باقی مانده شامل 8 قوچ و 58 میش به طور تصادفی انتخاب شدند. نمونه ها با استفاده از تراشه های50k گوسفندی شرکت ایلومینا، برای انجام پویش ژنومی روی وزن تولد تعیین ژنوتیپ شدند. درکنترل کیفیت SNPهایی که دارای نمره GC کمتر از 6/0، نرخ خوانش ژنوتیپی کمتر از 95 درصد و فراوانی آلل کمیاب کمتر از 05/0 از تجزیه کنار گذاشته شدند. بعد از کنترل کیفیت، مجموعه 41323 SNP و تعداد 130 رأس گوسفند برای تجزیه های بعدی باقی ماندند. در GWAS ارزش های اصلاحی برآورد شده برای وزن تولد به عنوان فنوتیپ در نظر گرفته شدند. نرم افزار Plink 1.9 بتا برای کنترل کیفیت و تجزیه GWAS به کار برده شد. اثرات SNPها با استفاده از نرم افزار GCTA برآورد شدند. هفت SNP معنی دار و مؤثر بر ارزش های اصلاحی وزن تولد روی کروموزوم های 1، 16، 19 و 22 شناسایی شدند. یک منطقه روی کروموزوم 1، در فاصله 253،533،863 و 253،590،200 جفت بازی، شامل معنی دار ترین SNP ها (s54564.1; P=7.572e-07 و s63115.1; P=9.242e-07) بود که پیوستگی بالایی با یکدیگر داشتند (D’ = 0.92 to 1 و R2 = 0.3). چهار ژن کاندیدا شامل RAB6B، عضو خانواده آنکوژن RAS؛ TF سروترانسفرین؛ KCNJ13 عضو 13 زیر خانواده J کانال های ولتاژی پتاسیم و GIGYF2، پروتئین دو GYF برهم کنش کننده با GRB10 روی کروموزوم یک شناسایی شدند. سه ژن کاندیدا شامل: DNTT، DNA نوکلئوتیدیل اگزوترنسفراز؛ OPALIN، پروتئین اولیگودندروسایتیک میلین پارانودال و