1404/02/01

پژمان محمودی کوهی

مرتبه علمی: دانشیار
ارکید:
تحصیلات: دکترای تخصصی
اسکاپوس: 25522218000
دانشکده: دانشکده دامپزشکی
نشانی:
تلفن:

مشخصات پژوهش

عنوان
ثبت توالی کامل ژنومی مشتمل بر بیش از 2100 ژن مختلف، متعلق به یک جدایه جدید از باکتری تروپرلا پیوژنز (Trueperella pyogenes) بومی ایران با شماره دسترسی CP028833 در پایگاه ژنومی NCBI به عنوان معتبرترین پایگاه ژنی جهانی، به نام دانشگاه بوعلی سینا همدان، ایران
نوع پژوهش
نوآوری
کلیدواژه‌ها
تروپرلا پیوژنز، توالی کامل ژنوم، NCBI
سال 1398
پژوهشگران ایرج اشرافی تمایی ، عبدالمجید محمدزاده ، تقی زهرائی صالحی ، پژمان محمودی کوهی ، آرش قلیان چی لنگرودی ، زهرا ضیافتی کافی

چکیده

پس از جداسازی باکتری تروپرلا پاوژنز بومی ایران، توالی یابی کامل ژنوم آن به روش ایلومینا انجام شد و نتیجه سکانس با ژن رفرانس، نقشه یابی و با برنامه CLC (Version 8) گردآوری گردید و در بانک ژنی NCBI با شماره CP028833 ثبت شد. این ژنوم کامل، مشتمل بر بیش از 2100 ژن مختلف، متعلق به باکتری تروپرلا پیوژنز، برای اولین بار از ایران و با نام دانشگاه بوعلی سینا همدان در بانک ژنی NCBI، به عنوان معتبرترین بانک ژنی جهانی ثبت گردید. در آنالیز و نقشه یابی، ژنوم این باکتری به طور دقیق شامل 2338282 باز نوکلئوتیدی، 2145 ژن، 2089 CDS، 2054 ژن کد کننده پروتئین، 56 ژن RNA، 47 tRNA، 3 ncRNA، 35 سودوژن می باشد.