پژمان محمودی کوهی

تعیین تیپ استافیلوکوکوس اورئوس جهت تعیین چگونگی توزیع و اپیدمیولوژی آن، ارتباط بین پاتوژن ها و طراحی روش هایی جهت کنترل بیماری های ناشی از آن ها امری لازم و ضروری می باشد. هدف از مطالعه اخیر، تعیین ارتباط ژنتیکی احتمالی بین جدایه های استافیلوکوکوس اورئوس با منابع مختلف و شناسایی مسیرهای احتمالی انتشار عفونت با استفاده از روش های مولکولی و فنوتیپی بود. این تحقیق یک مطالعه توصیفی- تحلیلی بود که در سال های 1393 تا 1395 انجام گردید. جامعه هدف در این مطالعه، 208 جدایه استافیلوکوکوس اورئوس (83 جدایه دامی، 60 جدایه انسانی و 65 جدایه غذایی) بود که همه آنها با استفاده از روش های فنوتیپی (بیوتایپینگ) و مولکولی شامل: (Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD و Restriction Fragment Length Polymorphism(RFLP) بر اساس ژن های spa (ژن کدکننده پروتئین A) و coa (ژن کد کننده کوآگولاز) مورد تایپینگ قرار گرفتند. در ادامه، تعدادی از جدایه ها با روش های (Staphylococcal Cassette Chromosome mec) SCCmec، ترادف یابی یک جایگاهی ((Single-locus Sequence Typing (SLST) ژن spa و الکتروفورز در میدان الکتریکی ضربان دار (Pulsed-field gel Electrophoresis (PFGE)) تیپ بندی شدند.آنالیز پروفایل ها و رسم دندروگرام برای روش های RAPD-PCR و PFGE به ترتیب با استفاده از نرم افزارهای NTSYS-PC و Gel Compar II انجام گرفت و تیپ های spa با نرم افزار (Applied Maths) BioNumerics 7.6 تعیین شد. از 208 جدایه استافیلوکوکوس اورئوس که با روش بیوتایپینگ دسته بندی شدند، 96 جدایه (2/46 درصد) متعلق به بیوتیپ های با میزبان خاص (Host Specific: HS) گزارش شد که شامل 30 اکوار انسانی، 23 اکوار گاوی، 30 اکوار گوسفندی و 13 اکوار مرغی بود و 90 جدایه (2/43 درصد) در گروه بیوتیپ های بدون میزبان خاص (Non-host Specific: NHS) جای گرفت و بقیه جدایه ها (6/10 درصد) در هیچ تیپی قرار نگرفتند. در روش RAPD-PCR، در مجموع 47 پروفایل مختلف مشاهده شد و در تشابه 80 درصد، 9 خوشه ایجاد شد که بیشتر سویه های جدا شده از منابع مختلف در خوشه های مشخص قرار گرفتند. درمجموع نتایج RFLP-spa در بین 208 جدایه استافیلوکوکوس اورئوس، با استفاده از دو آنزیم HindIII و HinfI، 15 الگو و در RFLP-coa با استفاده از آنزیم AluI، 12 الگوی مختلف ایجاد شد. در روش SCCmec تایپینگ هم، بیشت