میکروارگانیسمها پایه و اساس حیات بر روی کره زمین بوده و دو سوم تنوع زیستی کره زمین را تشکیل میدهند. این تنوع عظیم میتواند در جهت افزایش شناخت ژنهای جدید، مسیرهای متابولیک و محصولات آن مورد استفاده قرار گیرد. شناسایی تنوع ژنتیکی و زیستی ریز سازواره ها بخش مهمی از تحقیقات علمی را ت شکیل میدهد. 99 در صد میکروارگانیسمها را نمیتوان با روشهای ا ستاندارد کشت داد. برای درک تنوع ژنتیکی، ساختار جمعیت و نقش های بوم شناختی اکثر موجودات روشهای مستقل از کشت مورد نیاز است. متاژنومیکس (Metagenomics) قلمروای ا ست که امکان مطالعه ژنوم میکروارگانیسمهای ک شت ناپذیر را فراهم می سازد. این روش دریچه ی جدیدی در مطالعات محصولات تخمیری باز میکند. در این مقاله ابتدا با بیان متاژنومیکس، به برر سی کاربردهای آن در صنایع لبنی و سایر محصولات تخمیری پرداخته شده است.