کانسار آهن باباعلی در 37 کیلومتری شمال غرب همدان و در زون ساختاری سنندج- سیرجان قرار دارد . واحدهای سنگی رخنمون یافته شامل مجموعه ای از سنگهای آذرین اسیدی - حدواسط ، سنگ های دگرگونی شیستی واسکارنها است. این واحدها تحت تاثیر فازهای متعدد و شدید دگرشکلی، نظم اولیه خود را از دست داده و ساختارها و فابریکهای متفاوتی را بوجود آورده اند. زون برشی از ویژگی های این منطقه است. گسل ها وشکستگی ها نقش مهم و اساسی در هدایت محلولهای گرمابی داشته اند. مهمترین دگرشکلی و ساختار اصلی منطقه تحت تاثیر پهنه برشی شکل پذیر و شکنا حاصل شده است، آثار این دگرشکلی بصورت میلونیتی شدن ، گسترش برگوارگی ، چین ها، گسل هاو.... در سنگها تظاهر نموده است.