آنالیز سطح پلوئیدی جزء ضروری برنامه تولید گیاهان هاپلوئید و دابل هاپلوئید است. در این تحقیق به منظور تعیین سطح پلوئیدی گیاهان باززایی شده از طریق کشت بساک خیار از سه روش شمارش کروموزومی، مقایسه اندازه سلول های نگهبان روزنه و نشانگرهای مولکولی SSR استفاده شد. نتایج نشان دادند که در روش شمارش کروموزومی، تعداد کروموزوم گیاهان هاپلوئید باززایی شده نصف تعداد کروموزوم گیاهان مادری دیپلوئید می باشد. از سوی دیگر با مقایسه ای که بین اندازه سلول های نگهبان روزنه گیاهان هاپلوئید باززایی شده با گیاه مادری دیپلوئید انجام شد، مشخص شد که اندازه سلول های نگهبان روزنه در گیاهان هاپلوئید باززایی شده نسبت به گیاه مادری کوچکتر است و اندازه آن ها به طور معنی داری باهم متفاوت است. میانگین طول و عرض روزنه ها در گیاهان دیپلوئید مادری به ترتیب برابر با 3795/28 و 8602/21 میکرومتر بود در حالی که میانگین طول و عرض روزنه ها در گیاهان هاپلوئید باززایی شده به ترتیب برابر با 7006/18 و 0954/15 میکرومتر بود. هم چنین میانگین تعداد روزنه در دیپلوئیدها تقریبا 76 عدد و در هاپلوئیدها تقریبا 183 عدد در هر سانتی متر مربع بود. هم چنین استفاده از نشانگرهای SSR موجب شناسایی گیاهان هاپلوئید باززایی شده شد،. استفاده از این روش نشان داد که از میان 47 گیاه باززایی شده از طریق کشت بساک خیار،16 گیاه هاپلوئید یا گیاه دابل هاپلوئید و بقیه دیپلوئید سوماتیک هستند.