شانکر شیرابه ای مایع تیره رنگی است که از زخم ها و شکاف های پوستی بیرون آمده و به پایین تنه درخت می ریزد،. هدف از انجام پژوهش حاضر، جداسازی و شناسایی باکتری های مرتبط با شانکر شیرابه ای درختان بلوط، گردو، توت، نارون، صنوبر، بید، توسکا و ممرز در برخی از مناطق ایران و بررسی نقش احتمالی این باکتری ها در ایجاد علائم بود. پس از جداسازی و خالص سازی استرین های باکتریایی، بیماری زایی آن ها روی میزبان های هریک آزمایش شد. استرین های باکتریایی به دست آمده، با استفاده از شکل و رنگ کلنی، الکتروفورز پروتئین های محلول سلولی و ویژگی های فنوتیپی و ژنوتیپی شناسایی شدند. باکتری های گرم منفی جدا شده از شانکر شیرابه ای درختان مورد بررسی به عنوان اعضای خانواده های Pectobacteriaceae، Erwiniaceae، Yersiniacea،Morganellacea ،Enterobacteriaceae، Pseudomonadaceae، Xanthomnadaceae و باکتری های گرم مثبت به عنوان اعضای خانواده های Microbacteriaceae و Brevibacteriaceae جدا و شناسایی شدند. ازخانواده Pectobacteriaceae، گونه های Brenneria goodwinii از بلوط، گردو و ممرز، Brenneria roseae ssp. roseae از بلوط، گردو و ممرز، Brenneria izadpanahii از بلوط و ممرز، Brenneria nigrifluens و Brenneria rubrifaciens از گردو، Brenneria alni از توسکا، Brenneria salicis از بید، Brenneria sp. از صنوبر، Lonsdalea quercina از بلوط و Lonsdalea iberica از بلوط و گردو جدا و شناسایی شدند. از خانواده Erwiniaceae گونه های Pantoea agglomerans از بلوط، توت، توسکا و ممرز، Pantoea brenneri از توت و نارون، Pantoea vagans از گردو و Erwinia aphidicola از بلوط جدا و شناسایی شدند. از خانواده Yersiniaceae گونه های Gibbsiella quercinecans از بلوط، گردو، توت، نارون و ممرز، Gibbsiella greigii از بلوط، Rahnella aquatilis از بلوط، نارون، توسکا و ممرز، Rahnella victoriana از بلوط و Rahnella sp. از صنوبر جدا و شناسایی شدند. از خانواده Enterobacteriaceae گونه های Enterobacter ludwigii از بلوط و ممرز، Enterobacter sp. از نارون، Enterobacter cloacae و Enterobacter hormaechei از توسکا، Citrobacter freundii از بلوط و ممرز، Citrobacter farmeri از نارون، Klebsiella grimontii از توت و نارون، Klebsiella aerogenes از توت و Lelliottia amnigena از نارون