غلام خداکرمیان

باکتری های اندوفیت از میکروارگانیسم های غیربیماری زای ساکن بافت های گیاهی اند و می توانند باعث تأثیرات مطلوب بر افزایش متابولیسم، رشد و مقاومت گیاه در برابر عوامل بیماری زا و تنش های محیطی شوند. این مطالعه به منظور جداسازی و شناسایی بیوشیمیایی و مولکولی باکتری های اندو-فیت گیاهان نیشکر استان خوزستان انجام گرفت. برای این منظور نمونه برداری طی چندین مرحله در زمستان سال 95 و تابستان سال 96 از مزارع نیشکر واقع در کشت و صنعت های شمال و جنوب خوزستان، به صورت تصادفی، از بخش های هوایی ارقام مختلف صورت گرفت و پس از ثبت مشخصات لازم، نمونه ها به آزمایشگاه بیماری شناسی واقع در مؤسسه تحقیقات و آموزش نیشکر و صنایع جانبی خوزستان منتقل گردیدند. برای جداسازی باکتری های مذکور، برگ های نیشکر از ساقه جداسازی و در ارلن های شیشه ایی حاوی 100 میلی لیتر NaCl یک درصد حاوی ژلاتین، کاملاً خرد شده و سپس نیم ساعت روی شیکر 120 دور در دقیقه قرار داده، سپس سوسپانسیونی تهیه و سوسپانسیون حاصل روی محیط کشت عمومی YPGA (Yeast extract Peptone Glucose Agar) کشت و در دمای 25 تا 27 درجه سانتیگراد نگهداری شدند. پس از ظهور پرگنه ها در محیط کشت، خصوصیات بیوشیمیایی و مولکولی آن ها مورد بررسی قرار گرفت. جداسازی باکتری از برگ و غلاف نیشکر انجام شد ولی تراکم بالایی از باکتری ها در برگ ها مشاهده شد. براساس آزمون های گرم، اکسیداز، کاتالاز، O/F، لوان، پکتیناز، پروتئاز، تولید رنگ فلورسنت روی محیط کشت KB و رشد در دمای ºC40 جدایه ها در ده گروه قرار داده و نمایندگانی از این گروه ها جهت انجام آزمون مولکولی و تائید نهایی انتخاب شدند. مطالعه فیلوژنی جدایه ها براساس تعیین توالی ژن حفاظت شده 16S rRNA انجام گرفت. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک با استفاده از توالی ژن مذکور نشان داد که تنوع قابل توجهی در باکترهای نیشکر این منطقه وجود دارد. تعداد 14 گونه باکتریایی متعلق به 7 جنس شناسایی شد. جنس های شناسایی شده شامل: Burkholderia و Ralstonia از گروه β-Proteobacteria، Mesorhizobium و Ochrobactrum از گروه α-Proteobacteria، Microbacterium و Curtobacterium از Actinobacteria و در نهایت جنس Xanthomonas از γ-Proteobacteria. بیشترین فراوانی مربوط به گونه های جنس Burkholderia و کمترین فراوانی مربوط به جنس Xanthomonas بود. این اولین مطالعه از برر