غلام خداکرمیان

در طول فصل زراعی سال 1393، از شالیزارهای مناطق مختلف استان گیلان بازدید به عمل آمد و از گیاهان برنج فاقد علائم آلودگی به همراه خاک ریزوسفر و همچنین بذور برنج عاری از علائم آلودگی نمونه برداری صورت گرفت. به چه صورتی نمونه گرفتید؟ زیگزاگی؟ قطری؟ از کدام گیاهان؟ قوی ؟ ضعیف؟ چند نمونه؟ پس از مطالعات اولیه، جهت تفکیک جدایه ها از الکتروفورز پروتئین کل سلول های باکتریایی استفاده گردید و با مقایسه ی نقوش به دست آمده از تعداد 205 جدایه ی اندوفیت، اپی فیت و ریزوسفر خالص سازی شده، تعداد 154 جدایه در 7 گروه الکتروتایپی قرار گرفت. جهت انجام مطالعات بیوشیمیایی و مولکولی آتی، تعداد 79 جدایه ی منتخب از مجموع گروه های به دست آمده انتخاب گردیدند. با بررسی خصوصیات فنوتیپی جدایه ها، جنس های شناسایی شده شامل Pantoea spp.، Alcaligenes sp.، Stenotrophomonas sp. ، spp. Bacillus، و سودوموناس های غیر فلورسنت بود. فراوانی کدام باکتری مثلا در بذر زیاد بود و کدام کم بود. فراوانی کدام باکتری مثلا در ریزوسفر یا اندوفیت زیاد بود و کدام کمتر بود . جهت تأیید گروه بندی جدایه ها بر اساس پروتئین کل و میزان همبستگی این روش با روش های مبتنی بر DNA، از آزمون هضم آنزیمی محصول تکثیر شده ی ناحیه ی 16S r-DNA نیز استفاده گردید که بر اساس این روش جدایه های منتخب در 7 گروه تاکسونومی قرار گرفتند. از مجموع جدایه های مورد بررسی، %2/29 گرم مثبت و %7/70 گرم منفی بودند. در بین جدایه های گرم مثبت، %65 از جدایه ها به جنس Bacillus spp. تعلق داشت. در بین جدایه های گرم منفی نیز %3/39 از جدایه ها به جنس Pantoea spp.، %20 از جدایه ها به جنس Pseudomonas sp.، %3/10 از جدایه ها به جنس Alcaligenes sp. و %6/9 نیز به جنس Stenotrophomonas sp. تعلق داشتند و سایر جدایه ها نیز که فراوانی کمتری داشتند شناسایی نگردیدند. جدایه های جنس Bacillus spp. فقط در محیط ریزوسفر جداسازی شدند. جدایه های جنس Alcaligenes sp. از محیط ریزوسفر و اپی فیت، جدایه های Stenotrophomonas sp. و Pantoea spp. از محیط های اپی فیت و اندوفیت و جدایه های Pseudomonas sp. از هر سه محیط اپی فیت، اندوفیت و ریزوسفر برنج جداسازی گردیدند. در ادامه و پس از شناسایی گروه های باکتریایی به دست آمده، جهت مطالعه ی توانایی القاء رشد و جوانه زنی باکتری های مورد بررسی در میزبان برنج،