غلام خداکرمیان

چغندرقند مانند سایر گیاهان دارای طیف وسیعی از باکتری هایی است که روی قسمت های مختلف آن مستقر هستند. باکتری هایی که مرتبط با گیاهان هستند عبارت اند از ریزوباکترها، باکتری های اندوفیت و اپی فیت. جهت تعیین الگوی باکتریایی چغندرقند، در طول فصل زراعی سال 1393 از 12 منطقه مهم چغندرکاری غرب کشور بازدید به عمل آمده و نمونه های اندام های هوایی گیاهان شاداب و قوی به طور تصادفی با حرکت در قطرهای مزرعه گردآوری شد. درمجموع تعداد 452 جدایه باکتریایی جداسازی شد که از این تعداد 217 استرین متعلق به ناحیه ریزوسفر 70 استرین اپی فیت برگ و 85 استرین از اندوفیت برگ و تعداد 80 استرین نیز از بذر چغندرقند جداسازی گردید. برای انتخاب نماینده استرین های باکتریایی ابتدا پروتئین های محلول سلولی استخراج و به روش ناپیوسته لاملی الکتروفورز شدند. به طورکلی این استرین ها 54 الگوی پروتئینی مختلفی را از خود نشان دادند که در این میان هشت گروه الکتروتیپی که فراوانی بیشتری داشته و برای بررسی های بیشتر انتخاب شدند. ویژگی های فنوتیپی الکتروتیپ های برگزیده با روش های استاندارد باکتری شناسی تا حد شناسایی گونه بررسی شد. همچنین ژن های کد کننده 16S rRNA نماینده های هر یک از این الکتروتیپ ها با استفاده از آغازگرهای fD1 و rD1 به روش PCR فراوان سازی شد و پس از توالی یابی، با بانک داده های موجود در سایت NCBI با نرم افزار بلاست آنالیز و مقایسه شدند. نتایج نشان داد که الکتروتیپ های متعلق به گونه های Stenotrophomonas maltophilia، Pseudomonas fluorescens، Stenotrophomonas rhizophila، Pseudomonas aeruginosa و Serratia marscecens به ترتیب با فراوانی 14، 12، 12، 11 و 10 درصد بیشترین فراوانی در رایزوسفر چغندرقند را به خود اختصاص دادند. در بذر چغندرقند نیز گونه های S. rhizophila و Pseudomonas geniculata از گونه های رایج اپی فیت و گونه S. maltophilia به عنوان تنها گونه اندوفیت بذر چغندرقند بذر شناسایی شدند. همچنین در اندوفیت برگ چغندرقند مشخص شد که الکتروتیپ های متعلق به گونه های Acinetobacter calcoaceticus، S. maltophilia و P. aeruginosa به ترتیب با فراوانی 42، 20 و 15 درصد بیشترین فراوانی را به خود اختصاص دادند. در اپی فیت برگ، الکتروتیپ گونه های Bacillus simplex و S. maltophilia به ترتیب با فراوانی 48 و 25 درصد بالاترین فر