میوویسن و همکاران (2001) در مقاله معروف خود چگونگی استفاده از ابزار ریاضی و به خصوص تئوری بیز را در پیش بینی اثر نشانگرها جهت برآورد ارزش های اصلاحی ژنومی تشریح نمودند. بعد از آن محققین دیگر نیز چگونگی استفاده از این روش در برنامه های مختلف اصلاح نژادی را نشان دادند (شیفر، 2006 و طوسی و همکاران، 2009). در سال 2008 اولین ارزیابی ژنومی به منظور انجام انتخاب ژنومی در آمریکا در دو نژاد جرزی و هلشتاین انجام شد. در سال 2016 تقریبا 50 درصد از اسپرمهای استفاده شده جهت تلقیح مصنوعی از گاوهای نری که ارزیابی ژنومی شده بودند به دست آمد. یکی از مسائلی که در انتخاب ژنومی مطرح است بحث برآورد اثر نشانگرها است. بر این اساس روش های مختلفی برای برآورد اثر نشانگرها توسعه یافته اند.