این مطالعه به منظور بررسی رابطه نشانگرهای مولکولیRAPD و ISSR با صفت بیماریزایی جدایه های قارچ Cytospora chrysosperma (Pers.) Fr. روی نهال های گردو توسط رگرسیون مرحله ای با نرم افزارSPSS، 58 جدایه انجام شد. از بین 40 آغازگر مورد استفاده پس از بررسی بر اساس میزان تشکیل باند، چند شکلی و تکرارپذیری، تعداد 10آغازگر RAPD و 12 آغازگر ISSRانتخاب شد که آغازگرهایRAPD و ISSR به ترتیب 7/94 درصد و 8/95 درصد در بین جدایه های مختلف چندشکلی نشان دادند. طی این مطالعه صفت بیماریزایی به عنوان متغیر تابع و داده های مولکولی(صفر و یک) به عنوان متغیر ثابت وارد مدل رگرسیونی شد. با توجه به صفات وارد شده به مدل، باندهای با R2 بالا بررسی شد. نتایج نشان داد که پنج نشانگر RAPD با صفت بیماریزایی مرتبط بودند و در مجموع 7/43 درصد تغییرات این صفت را توجیه کردند که دو نشانگر رابطه مثبت و سه نشانگر رابطه منفی با صفت بیماریزایی نشان دادند. بیشترین درصد تغییرات توجیه شده مربوط به نشانگرA7=1900bp ( درصد =R22/18) و کمترین مقدار مربوط به نشانگرbp OP13=400 ( درصد =R28/4) بود. همچنین پنج نشانگر ISSR با صفت بیماریزایی مرتبط بودند و در مجموع 39 درصد تغییرات این صفت را توجیه کردند سه نشانگر رابطه مثبت و دو نشانگر رابطه منفی با صفت بیماریزایی نشان دادند. بیشترین تغییرات تبیین شده توسط نشانگر ISSR برای صفت بیماریزایی مربوط به نشانگرbp UBC864=350 ( درصد =R2 6/11) و کمترین مقدار مربوط بهbp UBC864=740 ( درصد =R2 4/5) بود از نشانگرهای شناسایی شده می توان برای گزینش به کمک نشانگر(MAS) و شناسایی جدایه ها استفاده کرد.