فلزهای سنگین برای جانداران، به ویژه انسان، جانوران، گیاهان و ریز جانداران زیان آور می باشند. هدف از این پژوهش ارزیابی پیامد آلودگی خاک و گیاه بر فراوانی باکتری های درونزی یا اندوفیت گیاهان در دو جایگاه آلوده و نا آلوده بود. در آغاز از خاک های معدن سرب و زمین های کشاورزی پیرامون آن و همچنین از اندام های هوایی 8 گیاه رشد یافته در خاک های یادشده نمونه برداری شد. غلظت سرب، روی و کادمیوم در خاک و برگ گیاهان گرد آوری شده اندازه گیری و شمارش باکتری های درونزی کشت پذیر انجام شد. نتایج نشان داد که غلظت فلزهای سنگین در نمونه های برداشت شده از خاک معدن به اندازه چشم گیری بیش از خاک زمین کشاورزی بود. توان گیاهان در جذب فلزها بسیار ناهمانند بود و غلظت سرب به ترتیب در گیاهان پونه بالاترین و پیچک پایین ترین و غلظت روی در گیاهان شکرتیغال بالاترین و فرفیون پایین ترین اندازه بود. شمارش باکتری ها نشان داد که فراوانی باکتری ها در خاک ها و گیاهان رشد یافته در خاک های نا آلوده به فلزهای سنگین کم و در برابر آن ها در خاک ها و گیاهان رشد یافته در خاک های آلوده به اندازه چشم گیری کمتر است. در میان گیاهان رشد یافته در خاک های آلوده میانگین لگاریتم فراوانی باکتری ها کشت پذیر بر NA در گیاه زلف پیر بیشترین و باکتری های کشت پذیر بر EMB در گیاه پیچک بیشترین بود. روی هم رفته این پژوهش نشان داد که فراوانی و گوناگونی باکتری های درونزی بسیار وابسته به خاک و نیز گونه گیاهی بود و این یافته ها در برنامه ریزی و شناخت رفتار باکتری ها در بوم سازه ها بسیار سودمند می تواند باشد.