باکتری اشریشیا کلی جزء فلور طبیعی دستگاه گوارش انسان، پستانداران و پرندگان است که عموماً بعنوان یک بیماری زای فرصت طلب محسوب می شود و حدود 15 درصد از جمعیت این باکتری را سویه های بیماری زا برای پرندگان تشکیل می دهند. هدف از انجام این مطالعه بررسی الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی در اشریشیا کلی های جدا شده از جوجه-های گوشتی مشکوک به کلی باسیلوز در مرغداری های گوشتی استان همدان بود. در مطالعه حاضر تعداد 100 نمونه از اشریشیا کلی های جدا شده از طیور مشکوک به کلی باسیلوز در مرغداری های استان همدان که در مطالعه قبلی جداسازی، شناسایی، تایید هویت و نگهداری شده بود مورد بررسی قرار گرفتند. در مطالعه فنتوتیپی به بررسی مقاومت آنتی بیوتیکی به روش انتشار دیسک پرداخته و سپس در بررسی ژنوتیپی با استخراج DNA از نمونه ها و انجام تکنیک PCR حضور 5 ژن مقاومت آنتی بیوتیکی شامل: tetA، qnrA،sul1، blaTEM و dfrA1like در ایزوله ها مورد بررسی قرار گرفت. نتایج این مطالعه نشان داد بیشترین مقاومت آنتی بیوتیکی با استفاده از روش انتشار دیسک به ترتیب نسبت به آنتی بیوتیک های پنی سیلین(89%)، فلومکوئین(86%)، تتراسایکلین(85%)، انروفلوکساسین(82%)، کوتریماکسازول(74%)، سولتریم(71%)، کلرامفنیکل(68%) و سیپروفلوکساسین(64%) مشاهده شد. .در بررسی ملکولی میزان حضور ژن های مقاومت tetA، sul1، dfrA1like و blaTEM به ترتیب 6268%، 63%، 51% و 30% گزارش شد. . نتایج این مطالعه نشان داد که مقاومت نسبت به اکثر آنتی بیوتیک های رایج در صنعت طیور ایران گسترده و بالا می باشد که لزوم اجرای طرح پایش ملی برای تعیین مقاومت ضدمیکروبی ضروری به نظر می رسد. همچنین با بررسی تنوع و فراوانی الگوی مقاومت دارویی جدایه های یک منطقه می توان درخصوص انتخاب آنتی بیوتیک های مناسب و موثر برای درمان کلی باسیلوز اطلاعات دقیقی بدست آورد تا از گسترش ژن های مقاومت و در نتیجه افزایش مقاومت آنتی بیویتکی در باکتری ها جلوگیری نمود.